多年来，临床医生一直使用基因组学来更好地告知治疗和个性化疗法。现在，Verici DX是一家位于田纳西州（美国）的免疫诊断公司，希望将该个性化药物镜头转变为另一个领域：肾脏移植。

每年在全球范围内，成千上万的患者每年接受肾脏移植，还有更多的翅膀等待。但是，即使在器官移植后，拒绝的风险也是不可预测的。目前，缺乏拒绝移植的高风险的准确测量值，因为接受者是否需要更高剂量的药物来应对其免疫系统，从而介导了拒绝。

临床医生通过测量尿液中的蛋白质浓度或血液中称为肌酐的分子水平来预测肾移植物的排斥。高肌酐或蛋白质水平可能表明临床医生需要采取更具侵入性的方法和活检肾脏来评估损害。但是，对活检的需求并不总是与蛋白质或肌酐水平高的相关性。“如果您进行活检，您会发现大约20％的人会被排斥，但是它们的信号正常来自尿液蛋白或血清肌酐。这些患者可能不受治疗，而拒绝可能会慢慢地造成长期损害。”

Verici DX现在正在验证他们的技术（使用人工智能来创建与受伤，拒绝或移植物相关的RNA签名）正在进行的临床试验整个美国和欧洲。在招募数百名患者的情况下，该试验将验证测试性能，并将RNA签名与病理发现进行比较，以支持为移植受者提供更准确和量身定制的护理计划。

Verici DX开发的技术是基于已故的芭芭拉·墨菲（Barbara Murphy）博士（Barbara Murphy博士）的研究，该研究是纽约西奈山医学院著名的移植肾脏科医生。从2008年到2015年，墨菲和她在美国和澳大利亚的合作者在A中招收了近600名患者临床试验研究他们的转录组，以了解为什么他们拒绝肾脏移植。这项研究通常称为“ GOCAR研究”（慢性肾脏同种异体移植排斥的基因组学），建立了一组参与免疫反应的基因，即使用专有算法，可以预测患者在肾脏移植后如何表现出来。Connolly说，正是这一数据构成了Verici DX进行分析的培训设置的基础。

^{IlluminaNextSeq2000。顶级照片：Verici DX首席执行官Sara Barrington（左）和COO Patti Connolly |照片：杰基·奥斯本（Jackie Osborne）}

对于Verici DX的试验，临床医生在移植之前和之后的各个时间点都从肾脏移植患者那里接受血液样本，并使用使用Illumina NextSeq™2000。Verici DX正在使用Illumina Connected Analytics（ICA），部署在Amazon Web服务（AWS）云上的安全基因组数据平台，以存储其RNA测序结果，处理测序数据并使用其算法来解188bet上不了释数据集。Verici DX首席执行官Sara Barrington说，ICA将是绝对基本的，他了解了他们从临床试验中收集的大量数据。

ICA使Verici DX能够处理大型数据集，并且还可以在软件平台内的样本中运行机器学习算法。该算法有助于解析基因特征，这些算法表明患者是否有拒绝的高风险，可以在移植后采用更量身定制的免疫抑制剂方案。Barrington解释说，该测试结果最终帮助临床医生了解患者的免疫系统的侵略性或良性，甚至在进行移植之前。

康诺利说：“我们正在与Illumina一起努力的工作是为临床医生提供更个性化的方法的机会。”

将来，巴灵顿（Barrington）希望Verici DX的预测能力可以完全放弃对侵入性活检的需求，因为血液样本将为患者的拒绝状况提供足够的线索。巴灵顿说：“重要性在于我们技术的可行数据。”“临床医生确实会将其添加到他们的工具带中，并[使用它]与他们的临床判断和其他因素一起做出决定。”