视频:给人鱼,你喂鱼-解锁鱼基因组,你喂世界

原创发布于Illuma新闻中心

联合国项目人类总人口到2040年将超过90亿向许多人提供食物需要可持续农作进步,特别是在水产业John Benzie博士、Karim Gharbi博士和Tarang Mehta博士最近与Illuma讲解他们的组织如何通过基因组学提高养殖罗非亚,最终目的是改善发展中世界的水产养殖

WorldFish:通过选择性育种提高水产养殖
本治是世界Fish首席科学家,总部设在马来西亚宾江组织努力改变水生食物系统以减少饥饿、营养不良和贫穷最突破性的成就之一是基因改良罗非亚或GIFT,1988年引入的有选择养分罗非亚菌株,生长速度比野生品种快两倍,规模更大。

Tilapia是世界第二大养鱼小农场可以养大它, 它是撒哈拉以南非洲、东南亚和南亚发展中国家蛋白质、铁、钾和其他养分的重要源头Benzie解释GIFT快速增长意味着农夫可以在短赛季增产鱼,

保持小农生产在经济和环境上的可持续性是WorldFish的首要利益之一GIFT向同意负责任地使用GIFT的研究组织或国家政府提供BRETSmlm,据它们的估计,今天GIFT分布14个国家并完全组成半点世界罗非亚制作

WorldFish继续通过选择性养殖程序提高鱼的特性,这些方案主要寻找疾病抗药性以及抗温度和盐度变化能力

Benzie描述这些程序如何逐步工作:“每年我们从前一代清除老鱼并使用最优鱼来培育下一代。 他们选择有前途的公有和母性对齐,编织鸡蛋并养活新生鱼令每个家庭分治,让我们知道谁是-父母-我们3个月后取下鱼并插入微信箱,以便识别每一条鱼。” 鱼一到成年便移到大水槽中,过程重新开始

决策中哪些配对可大大快速精确化,如果他们知道鱼的遗传信息-并找到正确伙伴解锁知识

厄尔汉姆学院:为工作寻找正确的基因
厄尔汉研究所是英格兰诺威治生命科学研究中心,使用基因组解码生物系统的规模和复杂性Karim Gharbi, 基因学管道主管,研究鱼类遗传标志以获取博士论文-他将职业生涯推向终生沉浸于Jacques Cousteau记录片中

实验后研究者Tarang Mehta想理解鱼基因调节基础, 具体地说,WorldFish提供足够基因组信息后,

厄尔汉姆研究所用IllumaNovaSeq XPlus系统从全世界各地的活鱼中提取小片鳍分离出他们的脱氧核糖核酸样本通过分析生成数据,他们可以识别表达理想特征的遗传标志

其中一些特征中,疾病抗药性可能是最关键-台拉比亚湖病毒单应负责全世界90%的luapia死亡率.Gharbi表示:“当我们在像水产业这样的农贸中发展出一种疾病时, 这可以开始从农场向农场扩散, 每一次暴发事件都对农夫是一种损失。越快帮助农夫养鱼越不易染病,

获取动物基因组是一个突破,改变WorldFish等组织操作方式:前例,播种者不得不直接暴露鱼受病毒感染,以便选择对病毒有更好抗药性的个人现在,他们可以避免这一步,快速求解,不造成不必要的伤害

NovaSeqXSeries:快速、精确和可持续的
厄尔汉研究所为英国内外许多用户服务,依赖用户快速、负担得起和持久生成高质量数据,加尔比和梅赫塔都证明NovaSeq XSeries在这方面的强项

Gharbi说,在最优条件下,他们可以在5天内接收WorldFish样本并返回结果在最近对学院“绿化作用”的评估中 NovaSeq XSeries可持续试剂帮助他们展示了减少废物的努力

光照NovaSeq X技术前沿Mehta补充道 允许速度和尺度排序多组化方法赋予他们更多权力应用发现改善粮食安全任务

mahta多次强化教程时, 将基因组学上的工作直接转换为维系食物多样性对他来说是多么重要快速变化世界中, 疾病不等待我们,环境改变不等待我们, 他说,“重要的是我们不仅要速度,还要快速数据规模-让我们翻译这些发现,然后快速返回田间,为基因组选择程序提供更好的信息。”

鱼可以淹死

听上去似反直觉,但如果水中氧气不足,鱼便会窒息Benzie解释说WorldFish关注区许多农夫缺乏工具在夜间清洗池塘-当藻类出现时停止光合成氧,但鱼仍在消费中隔夜氧气水平会下降 鱼会淹死农夫为了避免效果, 存储量约二分之二产生不幸循环:少股意味着低利润,甚至更少机会提升农场基础设施以容纳更多鱼解决之道之一 即养鱼以容低氧